Разные программы лабораторных методов анализа, направленные на выявление заболеваний, передаваемых половым путем, могут быть использованы при госпитализации, планировании беременности, в целях обследования половых партнеров, после случайных связей. В случае наличия симптомов инфекции целесообразно обратиться к врачу, который назначит нужные минимальные или расширенные комплексы исследований. Для постановки верного диагноза иногда бывает важно оценить изменения в соотношении разных групп микрофлоры слизистой оболочки генитального тракта. При некоторых условиях на первый план могут выходить инфекции, обусловленные условно-патогенными микроорганизмами (обычно не вызывающими заболевания).